Shopifyで安定した売り上げを維持するには、在庫管理の精度が欠かせません。商品の入出庫を正確に把握し、欠品や過剰在庫を防ぐことで、コスト削減と顧客満足の両立ができます。
特に、販売チャネルが増えるほど在庫の一元管理が難しくなるため、リアルタイムで在庫を追跡できる仕組みづくりが重要です。Shopifyでは、標準機能だけで基本的な在庫追跡・更新・非表示設定が行える他、外部の在庫管理システムと連携することで、複数倉庫やモール併売にも柔軟に対応できます。
本記事では、Shopifyの在庫管理を成功させるための基本知識から、運用に役立つ具体的な機能、さらに在庫データを活用した販売戦略の立て方までを詳しく解説します。
目次
Shopifyにおける在庫管理について
Shopifyで安定した売り上げを維持するには、正確な在庫管理が欠かせません。ここでは、在庫管理の基本的な考え方と、EC運営で直面しやすい課題について解説します。
在庫管理とは
在庫管理とは、商品の入庫から販売・出荷までの流れを正確に把握し、最適な数量を維持するための仕組みです。ECサイト運営においては、在庫を適切に管理することで「在庫切れによる機会損失」や「過剰在庫によるコスト増加」を防ぎ、キャッシュフローを健全に保てます。
また、消費期限やトレンドの移り変わりがある商品では、在庫管理の精度がそのまま利益率に直結します。特にマルチチャネル販売を行う環境では、リアルタイムで在庫を把握し、販売チャネル間の在庫差異をなくすことが重要です。
在庫管理を正しく行うことで、次のような効果が得られます。
- 廃棄やデッドストックの発生の防止
- 倉庫スペースの効率化による保管費用の削減
- 発注や補充のタイミングを正確に判断
- 顧客への迅速な配送体制の確立
単なる数量管理ではなく、経営効率を高める基盤として位置付けられる点が在庫管理の本質です。
在庫管理の基本的な方法
在庫管理の方法には、大きく分けて次の三つのアプローチがあります。
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継続在庫管理(永久在庫管理):商品の入出庫をリアルタイムで反映する方式です。販売が発生するたびに在庫数が自動更新されるため、常に最新の在庫状況を把握できます。Shopifyの標準機能もこの方式を採用しており、EC事業者に最も一般的な管理手法です。
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定期在庫管理:一定期間ごとに在庫数をカウントし、在庫データを更新する方法です。小規模店舗やオフライン倉庫を併用する場合に有効ですが、リアルタイム性が低いため販売チャネルが多い事業には不向きです。
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手動在庫管理:Excelやスプレッドシートを使い、手動で数量を記録・更新する方法です。商品点数が少ない事業者には手軽ですが、規模が大きくなると入力ミスや更新漏れが発生するリスクが高まります。
近年では、これらの方法をクラウド上で統合的に管理できる在庫管理システム(IMS/WMS)が主流です。ShopifyのようなECプラットフォームと連携することで、複数の倉庫やチャネル間のデータを一元的に扱えます。
ECにおける在庫管理の課題
EC事業では、ビジネスの拡大とともに在庫管理の難易度も上がります。特に次の三つの観点から、課題を理解しておくことが重要です。
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SKUごとの在庫管理:SKU(Stock Keeping Unit)は在庫を扱う最小単位で、例えば同じデザインのTシャツでも「色×サイズ」でSKUが異なります。SKUが増えると、それぞれの在庫数を適切に追跡する必要があり、管理の手間と複雑さが増大します。
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複数倉庫での在庫管理:複数の倉庫や店舗を運営している場合、各拠点の在庫を正確に把握し、どこから出荷するかを最適化することが求められます。Shopifyの「ロケーション機能」はこの課題を解決する手段の一つであり、倉庫・実店舗・委託業者など、物理的に異なる在庫の一括管理が可能です。
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販売チャネル間の在庫同期:自社ECサイトだけでなく、Amazon・楽天市場・実店舗など複数のチャネルで販売する場合、在庫データを自動的に同期しなければ在庫切れ商品を販売してしまうリスクが発生します。Shopify単体では他チャネルの在庫追跡が難しいため、外部の在庫管理システムと連携して一元化する仕組みが必要です。
このように、Shopifyの在庫管理を成功させるためには、標準機能の活用だけでなく、自社のSKU構成・倉庫体制・販売チャネル数に応じた設計を行うことが欠かせません。
Shopifyでの在庫管理方法①Shopifyの標準機能
Shopifyには、追加費用なしで利用できる在庫管理機能が標準搭載されています。ここでは、Shopifyだけで在庫を管理するための基本機能と操作手順、そして導入するメリットを詳しく解説します。
Shopifyで使える5つの在庫管理機能
Shopifyの管理画面には、日々の在庫業務をスムーズに行うための次の五つの基本機能が備わっています。
1.個別商品の在庫確認

「商品管理」画面では、全ての商品とその在庫数を一覧で確認できます。
「商品」画面では、カラーやサイズなどのバリエーションごとの在庫も個別に表示されるため、SKU単位での正確な把握が可能です。
さらに「在庫」画面では、在庫数・出荷状況などの条件で絞り込み検索もできます。
2.在庫数の追跡と把握

Shopifyでは、各商品の在庫をリアルタイムで追跡できます。設定手順は次のとおりです。
1. 管理画面で対象商品を選択する
2. 「在庫」項目で「在庫を追跡する」にチェックを入れる
3. 在庫切れでも販売を続けたい場合は「在庫切れでも販売を続ける」を選択する
4. 数量欄にロケーション別の在庫数を入力し「保存」する
この設定により、注文が入るたびに在庫が自動的に減算され、正確な在庫が把握できます。
3.在庫数の追加・変更
在庫の変更は、「在庫」や「商品の詳細」画面から直接入力する他、CSVファイルで一括更新する方法もあります。
複数の倉庫(ロケーション)を登録している場合は、拠点ごとに在庫数を個別に調整可能です。
4.在庫切れ商品の非表示設定
在庫切れの商品をそのまま掲載すると、顧客の購買意欲が下がる原因になります。
Shopifyでは「自動コレクション」で「在庫数が0より大きい」という条件を設定することで、在庫切れ商品を自動で非表示にできます。
なお、この機能を利用するには、事前に「在庫追跡」を有効にしておく必要があります。
設定手順は次のとおりです。
1. 商品の在庫追跡を有効にする
2. 各コレクションのスマートコレクション条件を次のように設定する
- 「商品の条件合致」で全ての条件を選択
‐ 「在庫個数」で、より大きいを選択して0を入力する
5.仕入管理情報の記録・確認
Shopifyでは仕入れ業者への注文書作成後、注文確定時点で在庫データを記録可能です。
また、複数ロケーション間での在庫移動もサポートしており、入荷予定や数量を各商品の詳細ページで確認できます。
標準機能のメリット
Shopifyの在庫管理機能を活用する最大のメリットは、シンプルかつ低コストで運用できる点です。
外部ツールを導入せずとも、Shopifyの管理画面上で全ての操作を完結できるため、初期費用や月額コストを抑えつつスムーズな運用が可能です。
また、リアルタイム更新や履歴確認、在庫レポートなどの自動化機能により、担当者の手作業を最小限に抑えられます。
特に少量の商品を取り扱うストアや、単一拠点での販売を行う事業者にとっては、最もコストパフォーマンスの高い在庫管理手段といえます。
在庫レポートと履歴管理の活用

Shopifyの在庫レポートは、月末時点での在庫状況を自動で記録し、次のような指標を分析できます。
- 月末の在庫スナップショット
- 1日当たりの平均販売在庫数
- ABC分析(収益構成比による商品分類)
- 販売率・在庫残存日数
また、在庫履歴では「いつ・誰が・どんな理由で在庫数を変更したか」を確認できるため、在庫差異の原因追跡にも役立ちます。これらのデータを活用することで、販売データに基づいた補充計画や発注数の最適化が実現します。
在庫レポートは、管理画面上の「ストア分析」→「レポート」の順にクリックし、カテゴリー内で「在庫」を選択すると、在庫関連のレポートを表示できます。
Shopifyでの在庫管理方法②外部の在庫管理システム
Shopifyの標準機能だけでも在庫管理は可能ですが、取り扱う商品数や販売拠点が増えると限界が生じます。ここでは、外部の在庫管理システムを導入するメリットや、Shopifyとの連携方法、標準機能との使い分けの基準を解説します。
外部の在庫管理システムを導入するメリット
外部システムを導入する最大の目的は、在庫データの精度と業務効率を高めることです。Shopifyの標準機能が小規模運営に適しているのに対し、在庫管理システムは次のようなメリットを提供します。
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事業規模に応じた柔軟な対応:SKU数や倉庫数が増えても、機能を拡張・調整できるため、事業の成長に合わせた効率的な運用が可能です。
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ヒューマンエラーの防止:在庫や注文データを自動で同期することで、入力ミスや更新漏れを防ぎ、正確な在庫管理を実現します。
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業務の自動化と効率化:受発注や在庫更新を一括処理でき、在庫アラートや自動発注などの仕組みも活用可能。作業時間を大幅に短縮します。
このように、外部システムの導入は、多拠点運営・高頻度出荷・モール併売などの環境で特に効果を発揮します。
Shopifyとの連携方法
Shopifyと在庫管理システムの連携方法は、主に次の三つです。
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Shopifyアプリ経由の連携:アプリストアから在庫管理アプリをインストールするだけで連携可能です。設定が簡単で、小〜中規模ストアに最適です。
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API連携:在庫管理システムの管理画面でShopifyのAPIキーを入力し、注文・入出庫・在庫情報を自動同期します。複数モール運営に向いています。
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双方向リアルタイム連携:販売と在庫データを同時に更新する方式で、在庫変動が即時反映されます。複数倉庫やマルチチャネル運営に最適です。
いずれの方法を採用する場合も、まずは連携先のシステムがShopify APIに正式対応しているかを確認しておくことが重要です。
Shopify標準機能との使い分け
外部システムを導入すべきかどうかは、ストアの規模・運営体制・販売形態によって異なります。次の基準を目安に判断しましょう。
Shopifyの標準機能で十分なケースは次のとおりです。
一方で、外部システム導入が必要なケースは次のとおりです。
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商品やバリエーションが多く、SKU単位での在庫追跡が煩雑
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倉庫や実店舗など複数ロケーションで在庫を保有している
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Shopify以外のモール(Amazon、楽天市場など)と併売している
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出荷量が多く、受注処理の自動化が必要
つまり、Shopifyの標準機能はスタートアップ向け、外部システムは拡張・成長段階向けと捉えると分かりやすいです。
Shopifyで使えるおすすめの在庫管理システム
Shopifyの標準機能では対応しきれない在庫数や拠点が増えた場合、外部の在庫管理システムを導入することで、より高度な在庫管理が可能です。ここでは、Shopifyと連携できる代表的なシステムを紹介します。
ネクストエンジン

ネクストエンジンは、6,500社以上が導入するEC運営の一元管理システムです。受注から出荷までの作業を自動化し、複数店舗・モールをまとめて管理できます。
在庫管理では、複数チャネルの在庫数を最短5分間隔で自動同期し、売り越しや在庫ズレを防ぎます。倉庫・POS・基幹システムとリアルタイム連携し、返品・キャンセル時も在庫を正確に反映します。拠点ごとの在庫振り分けや、単品・セット商品の自動連動など実運用に沿った管理が可能です。
料金は初期費用無料で、月額3,000円から利用できます。基本料金+従量課金制で、必要な機能だけを柔軟に追加できる仕組みです。
AnyLogi

AnyLogiは、国内外の物流を一元管理できるグローバル物流プラットフォームです。UPSやDHLなど主要配送業者と連携し、越境ECの配送・返品まで自動化します。
在庫管理では、ECモールやカートとリアルタイムで同期し、入出荷や在庫状況を一括管理できます。日本を含むアジア各国の倉庫と連携し、在庫の最適配置や土日出荷も可能です。データを基に在庫更新やアラートを自動化し、欠品・在庫過多を防ぎます。
料金は初期費用・システム利用料が無料で(条件付き)、入庫料1個20円、保管料1坪6,600円と明確な料金体系が特徴です。
OPENLOGI(オープンロジ)

OPENLOGIは、全国70拠点以上の倉庫ネットワークを活用したEC自動出荷システムです。常温・冷蔵・冷凍など幅広い商材に対応し、ShopifyなどのモールとAPI連携して業務を自動化します。
在庫管理では、リアルタイムでの在庫可視化や補充アラート機能を備え、温度帯・賞味期限・倉庫ごとの在庫分散も対応しています。入出荷から返品・再入庫までを自動で処理し、93%以上の自動出荷率を実現します。
料金は初期費用・固定費無料の従量課金制です。入荷・保管・配送費用は商材や物流状況に応じて個別見積もりです。
シッピーノ

シッピーノは、EC出荷業務を完全自動化するクラウド型システムです。Shopifyや楽天市場、Amazonなど主要モールとFBAなど1,800以上の物流サービスを連携できます。
在庫管理では、各モール間の在庫を自動同期し、ズレや販売機会損失を防止します。複数倉庫の在庫を一元管理し、出荷速度の最適化やギフト包装など特殊対応も自動化できます。
料金は初期費用0円、月額9,800円(税別)から利用できる従量課金制を導入しています。二つ目以降の倉庫連携は月額4,800円で、出荷件数やSKU数に応じた従量課金が発生します。
ロジクラ

ロジクラは、EC・実店舗・卸販売を一元管理できる在庫・倉庫管理システムです。Shopifyやネクストエンジンと連携し、複数拠点の在庫を統合管理します。
在庫管理では、実店舗とECの在庫をリアルタイムで共有し、欠品や過剰在庫を防ぎます。スマホアプリで検品・移動・棚卸しが可能で、ロット番号・賞味期限・セット商品の管理にも対応しています。
料金プランはLite(月額12,800円〜)、Premium(月額40,000円〜)、Enterprise(要見積もり)の3種類です。全て無料トライアルで全機能を体験できます。
LOGILESS(ロジレス)

LOGILESSは、OMS(受注管理)とWMS(倉庫管理)を統合した自動出荷システムで、1,500社以上に導入されています。受注〜出荷を一元化し、90%以上の自動出荷率を実現します。
在庫管理はリアルタイムで倉庫と同期され、賞味期限・ロット・温度帯別の在庫も正確に管理可能です。複数倉庫の運用にも対応し、セット商品の在庫計算やマーケティング施策も自動化します。
料金はライトプラン月額20,000円(税込22,000円)、スタンダードプラン月額25,000円(税込27,500円)で、出荷件数に応じた従量課金制を採用しています。
在庫管理を成功させるためのポイントと運用戦略
在庫管理システムを導入しても、運用体制が整っていなければ効果は発揮されません。ここでは、Shopifyストアが安定運営を続けるために意識すべき四つのポイントをまとめます。
在庫切れ・過剰在庫を防ぐ
過去の販売データを基に需要を予測し、在庫が一定数を下回った際に自動でアラートを出す仕組みを整えましょう。
また、安全在庫を明確に設定しておくことで、販売機会の損失を防ぎ、顧客満足度の低下も回避できます。
導入目的を明確にする
「手作業削減」「在庫精度向上」「配送スピード改善」など、在庫管理ツールを導入する目的を具体的に言語化しておきましょう。
目的が明確であれば、ツール選定や運用方針がぶれず、チーム全体で同じ方向性を共有しやすいです。
在庫管理と販売施策を両立させる
在庫最適化は重要ですが、売り上げを伸ばすためにはSEOやSNS、広告などの集客施策も並行して行う必要があります。
在庫を効率化するだけでなく、販売機会を増やすマーケティング戦略と組み合わせることが成功の鍵です。
顧客とのコミュニケーション強化する
在庫切れや発送遅延が発生した場合は、すぐに顧客へ通知を行い、誠実な対応を心がけましょう。
欠品メールや再入荷通知を自動送信する仕組みを整えることで、信頼を維持し、リピーター獲得にもつながります。
在庫データを分析して販売戦略に生かす
在庫データを分析し、売れ筋や死蔵在庫を見極めて販売戦略に生かすことが重要です。
売れ残りやすい商品はセット販売やキャンペーンで早期に消化し、人気商品は仕入れを強化して販売チャンスを最大化しましょう。